小结 | 1月下半月-2月上半月circRNA研究报道汇总

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欢迎各位来到“circRNA研究报道汇总”栏目，本期从pubmed中检索收集最新发布（1月15日-2月15日）的circRNA文献共计35篇，春节期间cell杂志同期连发2篇重磅级circRNA在肿瘤学中的研究，可谓开门红，为circRNA的研究提供了更丰富的资源和新视角，下面我们一起回顾下过去一个月circRNA有哪些进展。

1、局限性前列腺癌中环状RNA大规模功能研究

文献标题：Widespread and Functional RNA Circularization in Localized Prostate Cancer.

期刊：cell 

影响因子：31.398

通讯作者单位：加拿大多伦多大学

该研究由加拿大多伦多大学Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授共同主导，利用高通量测序RNA-seq和大规模shRNA文库技术系统系探讨了circRNA在局限性前列腺癌中表达特征和生物功能。研究者首先对144例前列腺癌标本，进行高通量测序，鉴定到7千多个circRNA分子，结合临床资料统计分析发现，circRNA表达特征与前列腺癌侵袭转移密切关联，shRNA文库技术发现其中约11.3%circRNA是前列腺癌细胞增殖必需，而这些circRNA对应的线性mRNA则不影响细胞增殖，表明circRNA的功能是独立且重要的，最后研究者重点关注的circCSNK1G3可以结合miR-181发挥功能，该circRNA在前列腺癌中稳定了miR-181的活性，共同促进癌症发展，区别于大多数文献报道的circRNA吸附miRNA模式。该文献详细解读，请点击我们公众号历史文章：重磅！ Cell杂志同期发表两篇circRNA研究文章。

2、癌症circRNA全方位研究

文献标题：The Landscape of Circular RNA in Cancer

期刊：cell   

影响因子：31.398

通讯作者单位：美国密歇根大学

美国密歇根大学的Arul M. Chinnaiyan教授团队，利用新型外显子捕获方法在2000例泛癌标本中检测外显子来源的circRNA，完整地获取了circRNA和对应线性RNA的表达量特征，并利用这些数据建立MiOncoCirc（https://mioncocirc.github.io/）数据库。同时该研究还发现了一类新的circRNA分子(rt-circRNA)---Read-through circRNA，即基因组中上游基因与下游基因的外显子反向拼接形成的circRNA，这与之前报道的融合基因来源的circRNA有所不同，rt-circRNA所对应的基因组并未发生任何序列变化。该文献也证实大部分circRNA表达模式与其来源线性mRNA没有必然联系，相对独立，提示circRNA的重要功能。Arul M. Chinnaiyan教授对circRNA作为无创生物标记物的潜力非常看好，circRNA的稳定性可以在癌症患者血液或尿液中检测到，提示对癌症诊断和预后的作用，同时他们在前列腺癌患者尿液中检测circRNAs分子的表达，将进一步探索这些circRNAs作为尿液或血液为基础的癌症生物标志物的价值。该文献详细解读，请点击我们公众号历史文章：重磅！ Cell杂志同期发表两篇circRNA研究文章。

3、RNA组学分子是癌症液体活检生物标记物的重要资源

文献标题：The circulating transcriptome as a source of cancer liquid biopsy biomarkers

期刊：Semin Cancer Biol  

影响因子：10.198

通讯作者单位：牛津大学约翰拉德克利夫医院

该篇综述文章系统性总结介绍了RNA分子（mRNA，small RNA，lncRNA和circRNA等）作为癌症液体活检生物标记物的重要潜能，回顾了已报道的作为癌症液体活检标记物的相关重要RNA分子。非侵入性生物标志物或液体活组织检查有可能彻底改变癌症患者管理，该技术允许重复采样实时监测疾病进展和对治疗的反应，容易实现早期干预和动态治疗管理，是个性化医疗的基石。循环系统中转录组研究数据是寻找潜在的癌症生物标志物的丰富资源，随着RNA-seq技术的快速发展，循环系统中发现越来越多的RNA分子，其包括编码和非编码许多类型的RNA，如mRNA，snRNA，snoRNA，piRNA，YRNA，lncRNA和circRNA。在这篇综述中，作者还特别阐述了，RNA分子成为常规临床实践的一部分仍有待克服的障碍和限制，值得进一步细读。

4、原发性乳腺癌中circRNA组学研究

文献标题：The circular RNome of primary breast cancer

期刊：Genome Res

影响因子：10.101

通讯作者单位：荷兰鹿特丹大学医学中心

该研究作者共分析了348个原发性乳腺癌的RNA-seq数据，并开发了一种不依赖于未映射读数或已知剪接点的识别circRNA的方法。共确定了95843个circRNA，其中20441个之前被报道发现。在匹配相同基因的外显子边界的circRNA中，668与线性基因的表达水平显示差或甚至负（R<0.2）相关性。生物信息分析表明，只有少数（8.5％）的circRNA可以用已知的剪接事件来解释。这些观察结果均表明circRNA存在特定调节过程。乳腺癌亚组相关的circRNA谱分析表明circRNA与乳腺癌淋巴细胞浸润量和增殖相关。研究者进一步证实了CNOT2，CREBBP和RERE来源的circRNA，siRNA敲低circCNOT2后可显著降低乳腺癌细胞系MCF-7和BT-474的增殖活力，此外，circCNOT2而非线性CNOT2表达水平可预测晚期乳腺癌患者芳香酶抑制剂（AI）治疗的无进展生存时间，并发现circCNOT2可在血浆中检测到。提示circCNOT2在乳腺癌治疗中的重要价值。

图注：A:circCNOT2表达与AI治疗患者Kaplan-Meier生存曲线临床评估;B:circCNOT2患者血浆样本中的表达

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